Détection directe de 3 espèces de Moraxella dans les écouvillons oculaires bovins

CORNÉE / INFECTION West Lafayette (USA) – La kératoconjonctivite infectieuse bovine (KIB) est associée à deux espèces de Moraxella : M. bovis et M. bovoculi. Les scientifiques autour de Rebecca P. Wilkes de la section de Pathobiologie Comparée de l’Université Purdue, à West Lafayette, États Unis d’Amrtique, a identifié dans les yeux de bovins atteints ou non de kératoconjonctivite une troisième nouvelle espèce de Moraxella, désignée provisoirement comme M. oculi.

Ces trois Moraxella spp. peuvent se trouver dans diverses combinaisons au sein d’un même échantillon clinique, ce qui rend la spéciation de ce genre directement à partir d’un échantillon impossible avec le séquençage Sanger. L’évaluation de la diversité des Moraxella présentes dans les yeux de bovins atteints ou non de KIB, indépendamment de la culture, peut fournir des informations supplémentaires sur la KIB en évitant le biais de sélectivité de la culture. Les chercheurs ont donc développé un panel de séquençage nouvelle génération (SNG) ciblé permettant de dédecter et de spécifier ces 3 Moraxella spp. directement à partir d’écouvillons oculaires bovins. Le panel ciblé amplifie les gènes essentiels bactériens et la région d’espacement intergénique (REI) de l’ARN ribosomique 16S-23S des 3 Moraxella spp. et les spécifie sur la base de ces séquences.

Dans l’édition de janvier 2024 du journal scientifique JOURNAL OF VETERINARY DIAGNOSTIC INVESTIGATION, les auteurs déclarent, que le panel a été capable de différencier les 3 espèces directement à partir de l’ADN extrait de 13 écouvillons (6 d’animaux sains, 7 d’animaux atteints de KIB, et tous les écouvillons sauf un (œil cliniquement sain) contenaient les 3 Moraxella spp. Le SNG ciblé avec séquençage des gènes de maintien de Moraxella spp. semble être une méthode appropriée pour la spéciation des Moraxella directement à partir d’écouvillons oculaires.

La Moraxella oculi, étant une nouvelle espèce associée à l’infection kératocornéenne bovine (IBK), n’a pas encore été largement étudiée en termes de résistance aux antibiotiques. L’étude de Gautier Hoarau dans le numéro de décembre 2020 du journal scientifique EUROPEAN JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY AND INFECTIUS DISEASES, „Moraxella keratitis: epidemiology and outcomes“, a révélé que la résistance aux antibiotiques n’était pas un problème majeur pour les souches de Moraxella impliquées dans la kératite. La plupart des souches étaient sensibles aux fluoroquinolones (97%), aux aminoglycosides (100%) et à la rifamycine (100%). Cependant, 93% des isolats produisaient une pénicillinase, rendant la pipéracilline et la ticarcilline inefficaces in vitro. D’autres études sont donc necessaires afin d’optimiser le traitement de cette pathologie. (um)

Auteurs : Wilkes RP, Kattoor JJ, Weng HY, Anis E. Correspondance : Rebecca P. Wilkes, Animal Disease Diagnostic Laboratory, Purdue University, 406 South University St, West Lafayette, IN 47907, USA. Mail : rwilkes@purdue.edu Étude : Targeted next-generation sequencing assay to detect 3 Moraxella spp. directly from bovine ocular swabs. Source : J Vet Diagn Invest. 2024 Jan;36(1):120-123. doi: 10.1177/10406387231216698. Epub 2023 Nov 29. PMID: 38018659; PMCID: PMC10734584. Web : https://journals.sagepub.com/doi/10.1177/10406387231216698